武汉科技大学意识形态安全研究中心下设6个研究所：高校意识形态安全研究所、网络意识形态安全研究所、主流意识形态建设研究所、意识形态安全管理研究所、宗教与意识形态安全研究所、文学艺术与意识形态安全研究所。